Au plan africain, l’IPR/IFRA est membre fondateur de ANAFE (Réseau Africain pour l’Education en Agroforesterie, en Agriculture et en Gestion des ressources naturelles).
Il entretient de bonnes relations avec AGRA (Alliance pour une Révolution Verte en Afrique), basée à Accra (Ghana) dont l’appui technique et financier a permis l’ouverture du master sous-régional en Gestion Intégrée de la Fertilité des Sols. L’Institut fait également partie d’un réseau d’écoles de formation doctorale dans l’espace CEDEAO dans le cadre d’une initiative germano-africaine pour le renforcement des capacités des ressources humaines sur la problématique des changements climatiques dénommée « WASCAL » (WestAfrican Science service Center on Climate Change and Adapted Land use».
A l’international, l’établissement entretient de bonnes relations avec l’Université d’Etat de Michigan (Etats-Unis) et l’Université de Laval (Québec, Canada).